教育部、交通部等新政府部门，由于内阁阻力较大，加上要改组清政府的六部存在较大问题，他也没有继续坚持在中央构建这些机构，而是法令中提到了一个新国家部门的过渡计划。

过渡期内，在法令中给予了地方足够的自治权，各省督抚可以依据此提议建立相关的地方机构，这也是之前上海督抚密议时承诺给地方更大自治权的内容，不过，地方政府的任命都需要经过内阁同意，这一点是确认内阁权威的必要手段。