为骄傲跋扈被自己处死，而毛文龙虽说有开镇一方，独挡一面的大将之才，但的确也有袁崇焕所说的放浪不羁，拥兵过重之嫌，且在私德纪律上也有所不足，再加上朝中不少大臣对一武官开牙建府颇多微辞，因而朱由校便没有让毛文龙直接管辽东半岛和登莱两地军政。

最后，朱由校不得不让兵部尚书卢象升空降海州卫，并开始统筹管理辽东半岛和登莱两府。

而蓟州的事务则交与杨嗣昌管理，如今禁卫军各地新军编练已经卓有