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数码兽生息的世界就是「数码世界」，由神秘的主计算机「世界树」管理着整个世界。

然而数码兽们的数据量巨大化程度超过了世界树的预测，包含数码世界在内的全宇宙规模的大爆炸「数码危机」迫在眉睫。再这样下去数码世界将面临崩溃。

数码兽的特征在于「进化」，他们会一口气让数据量肥大化并进化。让后再通过网络从数码世界外部流入信息，因此进行不规则进化的情况非常多。