经在雨隐村的毕业考试中以一己之力击败了50多名同期，也因为这件事，他被半藏看中并被收为弟子，结果没过多久，半藏被晓组织干掉了。

晓组织迅速占领了雨之国，半藏一系的力量遭到大清洗，小林直哉自然也被认定为是半藏一系，于是他被封印了查克拉，关进了地牢之中。

大起大落之下，年轻的直哉心理难以承受这道打击，最终他意志消沉，在不久前绝望的死掉了。