历史上，天京事变造成的最恶劣的影响并非信仰迷失，而是地方拥军自重，隐然独立。

尤其是太平天国后期，中央与地方矛盾重重，各个派系之间的矛盾已到了难以调和的地步。

例如，1860年，太平军二破清军江南、江北两大营。忠王李秀成取得苏南、浙江膏腴之地。英王陈玉成在苏南没有地盘，专门来到苏州谈判，要求李秀成分割苏南之地。

为此，洪秀全的族弟、军师洪仁玕亲自来到苏南，调解