其中，又以收编太平军、处置湘军战俘最为关键。

南路军主要有陈玉成、杨辅清、黄文金三支太平军。杨辅清、黄文金都是东殿大将，与吴捷关系密切。吴捷对陈玉成有救命之恩，而陈玉成的叔叔陈承瑢又是复兴会高官。

整编这三支太平军，预料不会遭到太大的阻力。经过二次西征，太平军已经见识到复兴军的超强战斗力，料想他们不敢轻言反抗。而不少太平军也期望成为复兴军，获得先进的武器、优良的衣食待遇。