和张居正讨论后，朱翊钧又将缅甸糜烂的报告付廷议。在朝廷上下讨论期间，朱翊钧又连着两天到武学讨论如何出兵事宜。

在军机处的讨论，一是决定是否使用京营，这一条在朱翊钧的力主之下，逐渐达成一致；二是派兵的规模、路线和后勤保障。

云南在帝国极西之地，进出全无通途，尽数为险隘山路。自京师而至滇，五千余里。若按走一段运河到湖广，再穿越贵州至云南这条路线；或由湖广进四川再到云南的路线