朱翊钧开始主政时，对运河的管理重视程度不是很够。他毕竟不是经济学家，以前也没研究过运河历史，因此心中对运河在帝国治政方面的地位认识高度没有张居正、王国光等人高。

到了万历三年，朱翊钧对运河的认识高度终于和张居正拉平。主要原因为两年来张居正等阁臣对运河管理的极度重视，凡有总漕奏章，张居正必然长篇累牍的分析利弊，往往还要请见，潜移默化改变了朱翊钧的想法。

张居正多次对朱翊钧