天巡抚曹邦辅兼总督漕运，以备倭寇。

其实原本应天巡抚是没有兵权的，一般是总理江南税粮，兼管漕运，直到屠大山在任期间才提督军务，专职剿贼，但之后屠大山兵败下狱，朝廷很快就设立了浙直总督一职，应天巡抚实际上成了浙直总督的下属。

从那之后，一直是南京户部兼管漕运，实际上之前南京户部就负责漕运，只不过主管的是应天巡抚而已，而如今总督漕运的正是南京户部左侍郎王诰。