建立了甘丹颇章教会政权，但西藏地方政府的世俗行政大权仍由固始汗及其子孙达延汗等操掌着。

朱慈炯登基以后，肃清内乱，迫使顺贼李自成远遁西域，放其一条生路的前提条件就是铲除青海等四省的土著势力，甘肃、宁夏两省大大小小部落首领虽多，然而离大明腹地也近，大明强盛之时，压制根本没有崛起的机会，等到大明衰落相互之间虽时有吞并，但为时尚短，想要统一谈何容易，李自成入两省几乎没废吹灰之力便完成了朱慈