除了这三大舰队的主基地外，李云天计划以后逐渐在大明海岸线上的一些天然优良港口设立了分水师分基地，既是守卫大明的海防线，同时也是便于舰队在防区内进行训练和巡航。

虽然水师三大舰队已经建立，不过在李云天看来他只是把海船和海防卫所的士兵召集起来而已，距离他心目中的水师标准相差甚远，需要加大资金投入和操练。

由于是宣德帝御命的组建大明水师的主官，李云天当仁不让地担任了水师统领