检率领明军主力在西伯利亚一带扫荡，等到他们回国，至少是一个月后，所以镇压叛乱的任务，便落在了平南王李定国身上。

崇祯二十六年，李定国率兵平定台·湾不久，朱由检开始征伐倭国，李若琏和他的福建水师便被带调往倭国，将对大明不敬的幕府将军，以及他的臣子们猛烈打击，用皇上本人的话来说，要明军做到“大军过后，鸡犬不留。朱由检的三光政策还没来得及实施，白莲教暴动就开始了。

在得知各港口相继沦