主角也和另外一个主要角色，在主角大脑中的强尼银手一起并肩作战。

最后的结局就是主角通过自己之前做过许多支线任务和主线任务结识的伙伴一起杀上新的荒坂集团大厦。

这一次主角不再仅仅只是一个黑客，他为了给杰克报仇，亲自冲在第一线，当然第一线他也不是主要作战人员，主要作战的还是他身边的那些伙伴。

有曾经强尼银手的老相好罗格，还有在某主线任务结识的流浪者集团成员帕南，因为主线芯