名义上，根负责暗部忍者的培训工作，但实际上两者几乎是彼此独立的机构，职能相似，但却分别听命于根统领团藏和暗部统领。

这是特殊的历史、政治原因造成的，木叶本没有必要设置一个独立于暗部的所谓培训部门。

因此团藏被终身囚禁之后，不知火玄间一人独揽「根」和暗部，两个组织遂开始合并，组成新的暗部。

58年3月。