当李元利正在轰轰烈烈地练兵、屯田、建设时，四川的形势又发生了巨大的变化。

在这之前，大西军孙可望已经离开云南并占领了贵州全境，派刘文秀所部已经基本上平定了四川，社会生产也在逐步恢复，这种情况下，满清朝廷在给吴三桂颁发平西王金册金印的同一天，即顺治八年（1651年）九月八日，同时向他发布了出征四川的命令。

这次的皇帝诏令，给了吴三桂比以往更大的权力，把地方的军事大权都交他