同时将百矿署、器械所同归工部，由黄安任工部都统领！

刑部主管刑罚政令及审核刑名的机构，掌控梁山地域治安等，由黄信任都统领。

至于其他职能，由小六部内部统筹，各部兵马即日起，归将军府统辖，各部将领，由天策将军赐文书，方有征伐之权。

改制各部兵马，以威武军为马军，神游军为水军，神威军为步军，巡查营解散，由威武军、神游军、神威军各自建巡查职能，各自统领归入三军之中。