早在朱由校来张家口之前，便已经让吏部尚书崔呈秀和礼部尚书钱谦益联合准备对新增州县官的补缺。

为此，在占据科尔沁部、喀尔喀部等漠南蒙古的广袤领地和宁锦一带的土地后，朱由校便立即命第四军都督佥事杨廷麟临时充任漠南巡抚，同时，骑兵第三旅将常驻漠南科尔沁部应昌城，旅参将刘世玉为漠南都指挥使，以起到武力震慑作用。

杨廷麟被任命为漠南巡抚后，便宣告漠南地区军管结束，且代表着漠南蒙古