南科大和深海大学一前一后成立，两所大学的校园又仅有一条马路之隔，所以难免被放在一起比较。

深大的背后是深海特区政府在大力支持，划拨给校方的5000万人民币建设资金，都是从市财政预算中努力挤出来的，国家和省里没有给过一分钱。

而南科大背后站着的是世界首富“财神李”，南科大的第一笔捐款正是来自于东方集团。东方集团向南科大捐赠了5000万美元，其中第一笔3000万美元的资金，