大和乘坐宝石海星号沿着杰可罗拉群岛返回关东的枯叶市。

正好公司从关东到城都的船正在枯叶市休整，打算三天后载着前往城都旅游的游客出发，到时候会停靠在真新镇南边的比努海滩。

大和可以在比努海滩上船，然后前往城都地区。

安排好了船只的运行计划后，大和与新田就放心的去真新镇找大木博士，企图学习大木博士掌握的先进培育技术，以及获取他这些年收集的神奇宝贝资料。