他像第一部那样与自己的宝可梦们一起相遇，故事的主线并没有发生太大的变化。

依旧是收服宝可梦、训练、挑战道馆、参加联盟大赛

就这样，剧情一直到了「夏树」的宝可梦巴大蝴即将去世的时候。

那时，变故突生。

一道来自未来的光芒射进了巴大蝴的体内，让巴大蝴活下来了。

原来是未来的人们知道了夏树所经历的一

切，他们被感动了，用最新研发出来的