而吴应箕、杨廷枢、沈士柱等人均未被释放，加上这次朱集璜、郑敷教、沈寿珉、巢鸣盛、姜垓、文秉等人。

东林因为大量骨干遭到逮捕，几乎一蹶不振，而实力更弱的复社更是于此番遭到了毁灭性打击。

几社由于徐孚远、陈子龙的出走，以及周茂源和宋征璧成为贰臣，已经名存实亡了，浙傥也没好到哪去。

此番与朝廷和皇帝相抗，江南士林，尤其是南都城内的主力军，遭到了前所未有的重创。