大明的省级行政机构和后世差别很大，比如登莱、属于山东布政司管，但他有自己的巡抚，登莱巡抚的权限并不比山东的三司使低，甚至他的直属权限还要高出不少。在大明真正的封疆大吏是巡抚，很多省设有两三个巡抚府。比如陕西省就有延绥巡抚和陕西巡抚。巡抚之上的封疆大吏是总督，而总督不是常设官职，有时候两三省才设一总督，而有的地方不是省级单位，但却设了总督，如宣大总督。

省级的三司等行政机构倒像是宋