到了宗教战争时期，又出现了路德宗、加尔文宗等新的教派，统称“新教”。

统治着神圣罗马帝国的奥地利皇帝在三十年宗教战争失败后，不得不承认新教诸侯的合法性。

至此，新教成为了和天主教、东正教并立的第三大教派。

英国的圣公宗同样属于新教的一种流派，受英国国王控制。

值得一提的是，圣公宗之中后来又诞生了一批福音