山茱萸与天麻、桔梗、裕丹参、黄姜、杜仲、唐河栀子、板蓝根为主的中药材基地发展迅猛。目前，全市境内已经确定的天然中药材达2357种，地道名优中药材50多种，中药材总储量2.5亿多公斤，其中山茱萸、辛夷的全国市场占有率分别达到60％和70％，被命名为全国‘山茱萸之乡’、‘辛夷之乡’、‘栀子之乡’。

此外，南苑市被称为‘世界艾乡’，有艾草企业1530家，有10多万名农民从事艾草种植