三管领皆是足利亲族，管领又拥有管理幕府的职权，不论家格和官职都严重威胁着足利天下。

足利义辉之母，十二代将军与阿波细川宗家发生冲突，细川家督上洛成为实权管领统帅幕府。

十二代将军被迫离开京都，辗转各地，丢失了对幕臣的掌控。

而阿波细川宗家也没有好下场，被家老三好长庆篡夺四国根基，毁家灭族。

到了足利义辉时代，山名家在西国苟延残喘，斯波宗家在尾张被守护代织田